Eszter Lakatos

Projektsammanfattning

Ett nytt sätt att studera cancerimmunogenicitet på systemnivå

Tillväxten hos cancerceller påverkas av hur de interagerar med immunsystemet. Cancerceller har många genetiska förändringar (mutationer) i sitt DNA, vilket gör att de skiljer sig från friska celler. En del av dessa förändringar påverkar molekyler på cellens yta.  Förändringarna guidar immuncellerna i kroppen så att de kan hitta cancerceller och attackera dem. Bättre förståelse för detta samspel är avgörande för att kunna utveckla bättre behandling för cancerpatienter. Det finns fortfarande många obesvarade frågor såsom vilka mutationer som spelar roll, om immuncellerna aktivt letar efter cancerceller och om kemoterapi hjälper immunförsvaret. Projektet utvecklar Eszter beräkningsverktyg som kan analysera stora datamängder för at besvara dessa frågor.

Istället för att studera enskilda mutationer och immunceller så studerar man i projektet alla molekyler som kan finnas på cellens yta (både de som är specifika för cancerceller och för friska celler) för att se vilka molekyler som gör att cellen kan bli upptäckt av en immuncell. Därefter studerar forskargruppen olika celler som finns i, och omkring, cancertumören och använder matematiska metoder för att modellera hur stark interaktionen är mellan olika celler. Är det till exempel så att immunceller attraheras till cancercellerna och drar sig mot dem? Genom att kombinera de olika metoderna så vill forskarna bygga ett verktyg som kan användas för beräkna cancerimmunogenecitet utifrån data som går enkelt att samla in i den kliniska verksamheten.

Slutligen planerar Eszter och hennes medarbetare att skapa en så kallad digital tvilling, det vill säga en digital representation av en verklig cancertumör. Den kan användas för att teoretiskt testa vilka behandlingar som är bäst lämpade att kombinera för att behandla, med hjälp av immunsystemet, just denna tumör.